Como toda herida puede infectarse o sangrar, causar edema en el ano y en casos menos frecuentes causar dolor prolongado en la zona de la lesión, complicaciones que suelen resolverse con medicamentos. Es posible que sean necesarias varias cirugías para resolver el problema. Entre las complicaciones más graves, pero infrecuentes, puede producirse incontinencia para gases o heces, así como infección perineal importante.